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細說蛋白樣品制備關鍵點

發布時間:2021/5/10 8:49:41      閱讀次數:792

 蛋白質樣品的制備,是蛋白質研究的第一步,不論后續采用何種分離或鑒定手段,樣品制備都是重要步驟。

蛋白質樣品制備的意義

  1. 生物的蛋白質種類多達10萬種以上,樣品中的蛋白質種類也可達到1萬種以上,但大部分蛋白質的拷貝數很少,因此通過樣品制備起到濃縮蛋白質的作用。

  2. 去除樣品中各種非蛋白質的影響。

如何進行蛋白質的制備

蛋白樣品制備包括蛋白質的分離,提取和純化。從各類研究角度而言,樣品制備都要盡可能獲得所有樣品中的蛋白質,但是由于蛋白質種類多,豐度不一,物化特性多樣等因素,要到達真正的完全蛋白質制備是非常困難的。

在制備中丟失的蛋白是永遠不可能在后面試驗中彌補回來的!

樣品制備的原則:

  1. 盡可能采用簡單的方法進行樣品的制備。

  2. 盡可能提高樣品的溶解度,使所有待分析的蛋白質樣品全部處于溶解狀態,且穩定可重復。

  3. 盡可能減少蛋白的降解。

  4. 根據下游實驗選擇決定提取蛋白的方法,例如提取變性還是活性蛋白,提取總蛋白還是亞細胞結構組分蛋白。

  5. 盡量去除干擾下游應用的雜質,包括但不僅限于核酸,組織碎片,或某些高豐度無關蛋白。

樣品制備的基本流程:

  1. 樣品的破碎

  2. 樣品的裂解

  3. 雜質的去除及蛋白質溶液的獲取

樣品的破碎

為了完全分析細胞內蛋白,樣品必須經過有效的破碎,破碎方法的選擇依賴于樣品來源不同(如組織,固定組織,難研磨組織,脂肪,菌體)而不同,同時也依賴于提取蛋白的類型(如是獲取總蛋白還是特殊的亞細胞結構組分)。

通常組織樣品和微生物樣品都需要進行破碎處理,而細胞樣品不需要。破碎可以通過滲透,凍融,酶解,超聲,高壓,液氮研磨,機械勻漿,玻璃珠勻漿等方式完成。選擇破碎方式時也要考慮使用的裂解液配方是否可以完美的配合,以得到最佳的提取效果。提取總蛋白時需要盡量的破碎樣品釋放蛋白,而特殊的亞細胞結構分離則需要根據提取方法采用合適的破碎方式。

 

提示:內源性的蛋白酶通常存在于細胞質內,在細胞破碎時可能會釋放出來,導致某些蛋白質的降解,從而影響下游實驗結果,因此可在細胞裂解前添加蛋白酶抑制劑加以保護。

樣品的裂解

 

樣品裂解是指對蛋白質進行增溶性溶解的過程,可通過破壞蛋白質與蛋白質,蛋白質與非蛋白質之間的相互作用完成。通常裂解液中會添加表面活性劑,不同的裂解液配方所能溶解和獲取的蛋白種類和得率會有較大差別,所得到的蛋白譜也會不同,所以看似簡單的樣品裂解卻是決定整個實驗成敗的關鍵點。優質的裂解液配方既能實現蛋白質間的良好分離,又不影響下游實驗。

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去除雜質和蛋白質獲取

蛋白樣品中的雜質主要包括核酸,脂類,組織碎片等,這些雜質均會干擾下游實驗。特別是核酸雜質會增加樣品的粘度,可能會引起下游實驗中凝膠孔堵塞,核酸與蛋白結合阻礙聚集,銀染或WB背景過高等問題,所以需盡量去除雜質。去除雜質后即可獲得蛋白質溶液。傳統的提取方法(如RIPA裂解液和溶液法提取的試劑盒)缺少有效的雜質去除步驟,通過離心取上清的方式獲取的蛋白質無法完全去除雜質,且獲得的蛋白純度較低,同時也會損失較多蛋白質,從而影響蛋白的提取質量,改變樣品中真實的蛋白譜。新一代柱式總蛋白提取法突破了傳統方法的困境,利用離心管柱技術,可有效去除蛋白中的核酸雜質,提高蛋白純度,配合優化的裂解液配方,無蛋白丟失,一管式操作,可快速獲取高質量的蛋白質樣品。降低下游檢測難度,提高數據真實性。

 

亞細胞結構分離

 

大部分實驗通常可以用總蛋白組分進行蛋白質的分析,但是涉及到某些低豐度蛋白或者蛋白細胞定位和蛋白轉運研究時,則需要進行樣品的亞細胞結構分離,也就是將樣品中的蛋白分成幾個組分,分別進行蛋白質的研究。根據蛋白質在細胞中不同的細胞定位進行分離,可分離細胞核,細胞膜,內質網,線粒體,高爾基體,溶酶體,內體等結構。亞細胞結構分離不僅可以提高低豐度蛋白質的上樣量,降低檢測難度,還可以針對某一細胞組分的蛋白質進行分析。傳統的亞細胞結構分離主要是將樣品勻漿后,進行密度梯度離心分離不同組分,傳統提取方法操作步驟多而復雜,所需起始原料量極大,需使用超高速離心及配制密度梯度溶液,得率較低,失敗率高,使得下游實驗困難增加,阻礙深入研究進程。為了加速科研者在蛋白領域深入研究的腳步,打造了柱式法亞細胞結構分離平臺,配有全套的動植物亞細胞結構分離工具,可分離內質網,高爾基體,溶酶體,線粒體,內體,細胞膜,葉綠體,外泌體,微粒體,細胞核等,僅需極少的樣品,無需超高速離心,即可獲得高質量的亞細胞結構。

 

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