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重組質粒的轉化及陽性克隆的鑒定

發布時間:2021/12/8 10:50:24      閱讀次數:617

 1材料
    E.coliJM109菌株
    2儀器、用具
    超凈工作臺、離心機、恒溫搖床、恒溫培養箱、培養皿、試管、1.5ml離心管、電泳儀、電泳槽、凝膠樣品梳、移液器
    3試劑
    (1)CaCl2、LB平板(見附錄);SOC培養基(見附錄);SOB培養基
    (2)RNaseA1;BufferS1;BufferS2;BufferS3;BufferW1;無水乙醇的BufferW2a
    (3)1×電泳緩沖液(TAE);溴化乙錠溶液(EB)[有毒,小心];瓊脂糖;6×加樣緩沖液
    (4)酚;
    (5)ddH2O;10×PCRBuffer(Mg2plus);dNTP;M13;M13-;TaKaRarTaq酶
    4方法
    1.大腸桿菌感受態細胞的制備
    (1)取大腸桿菌JM109保存液50μl,接種于4mlLB(或SOB)液體培養基中,37℃,300rpm振蕩培養過夜,第二天取50μl轉接到新的4mlLB(或SOB)液體培養基中擴大培養3h至OD600=0.35~0.4,在無菌操作臺上取1ml菌液于1.5ml離心管中,冰浴10min。
    (2)4℃,5000rpm離心2min,去上清液。
    (3)加入750μl預冷的0.1MCaCl2重懸菌體,冰浴30min。
    (4)4℃,5000rpm離心2min,棄上清液。
    (5)加入100μl冰冷的0.1MCaCl2輕輕重懸菌體,冰浴2h后,4℃保存備用。
    2.重組DNA的轉化
    (1)將含Amp、X-Gal、IPTG的LB平板37℃預熱。
    (2)于100μl感受態細胞中加入10μl連接產物,冰浴30min。
    (3)將離心管轉入42℃水浴,熱沖擊90秒,然后不要搖動離心管,迅速將其放在冰上2min。
    (4)在離心管中加入SOC培養基300μl,槍頭混勻,37℃、150rpm溫和搖振60min。
    (5)將200μl轉化菌液均勻地涂布于含50mg/mlAmp、20mg/mlX-gal、200mg/mlIPTG的LB平板上,37℃倒置培養過夜,挑選白色菌落進行鑒定。
    注意事項:
    ①制備感受態細胞的全部操作均須于冰浴操作,同時注意近火無菌操作,防止感受態細胞受雜菌污染。
    ②42℃熱處理時很關鍵,轉移速度要快,且溫度要準確。
    ③菌液涂皿操作時,應避免反復來回涂布,因為感受態細菌的細胞壁有了變化,過多的機械擠壓涂布會使細胞破裂,影響轉化率。
    3.重組質粒的鑒定
    方案一菌落PCR
    (1)制備PCR混合液:
    (2)用經滅菌的10μl槍頭(不用牙簽)挑去白色菌落,迅速地使挑取物溶在上述混合液中。
    (3)蓋上離心管得蓋子,在沸水上溫育10min。
    (4)將步驟⑶的樣品冷卻至室溫,離心數秒,然后于管中加入TaKaRarTaq酶0.25ul。
    (5)按以下條件進行PCR反應:94℃預變性3min;然后進行30個循環反應,其溫度循環條件為:94℃變性1min,57℃退火1min,72℃延伸1min;循環結束后72℃再延伸5min。
    (6)取5μlPCR產物在1%瓊脂糖凝膠上進行電泳檢測。
    方案二質粒PCR
    1.堿裂解法少量制備質粒DNA
    (1)用離心管收集4ml在LB培養基(含Amp)中培養過夜的菌液,14000rpm離心30秒,棄盡上清。
    (2)用250μl已加入RNaseA1的BufferS1充分懸浮細菌沉淀。
    (3)加入250μlBufferS2,溫和但充分地上下翻轉混合4-6次,此步驟不宜超過5min。
    *BufferS2使用后應立即蓋緊瓶蓋,以免空氣中的CO2中和BufferS2中的NaOH,降低溶菌效率。
    (4)加入400μlBufferS3,溫和地上下翻轉8-10次,室溫靜置2min,14000rpm離心10min。
    *若離心后凝結塊未沉淀到離心管底部,應再上下翻轉數次,12000g離心3min。
    (5)將DNA-prepTube置于2-mlMicrofugeTube中,將步⑷中的混合液移入DNA-prepTube中,5500rpm離心1min。
    (6)棄濾液,將DNA-prepTube置回到原2-mlMicrofugeTube中,加入500μlBufferW1,5500rpm離心1min。
    (7)棄濾液,將DNA-prepTube置回到原2-mlMicrofugeTube中,加入700μl已加無水乙醇的BufferW2,5500rpm離心1min,以同樣的方法再用700μl已加無水乙醇的Buffer
    W2洗滌一次。
    (8)棄濾液,將DNA-prepTube置回到原2-mlMicrofugeTube中,14000rpm離心1min。


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