離心柱式RNAeasy™動物RNA抽提試劑盒(RNAeasy™ Animal RNA Isolation Kit with Spin Column)是一種基于離心柱法從動物組織或培養的動物細胞中安全、快速、便捷、穩定、高效、高質量地抽提長度大于200個核苷酸(nucleotide, nt)的RNA的試劑盒。抽提獲得的大于200個核苷酸的RNA(也常被稱為總RNA)可以用于各種常規用途。
本試劑盒抽提得到的RNA可用于反轉錄、RT-PCR、qPCR、Northern、點雜交(Dot Blot)、純化mRNA、體外翻譯、RNase protection assay、cDNA克隆等下游實驗;也可用于基因表達芯片分析(microarray)、高通量測序(high throughput
sequencing)等對RNA質量要求較高的情況。
三款離心柱式及Trizol法RNA抽提試劑盒的主要特點和差異如下:
產品編號 | R0024/ R0026/ R0027 | R0028 | R0032 | R0011/R0016 |
產品名稱 | RNAeasy™動物RNA 抽提試劑盒 | RNAeasy™動物小RNA 抽提試劑盒 | RNAeasy™ Plus動物RNA 抽提試劑盒 | Beyozol Trizol |
推薦指數 | ★★★★★ | ★★★★★ | ★★★ | ★★ |
抽提方式 | 離心柱式 | 離心柱式 | 離心柱式 | 原始方式 |
抽提產物 | RNA(>200nt) | 小RNA(<200nt) | 總RNA(含<200nt的小RNA) | 總RNA(含<200nt的小RNA) |
操作時間 | 最短(15-20分鐘) | 稍較長(20-25分鐘) | 較長(25-30分鐘) | 最長(45-60分鐘) |
操作步驟 | 4步驟(少) | 6步驟(多) | 6步驟(多) | 很多步驟 |
使用便捷性 | ★★★★★ | ★★★★ | ★★★★ | ★★ |
推薦細胞量/得率 | 50-100萬/5-20μg | 50萬/1-2μg | 50-100萬/5-20μg | 50-100萬/5-20μg |
推薦組織量/得率 | 5-20mg/10-40μg (多) | 5mg/1-1.5μg (少) | 3-5mg/3-10μg (少) | 50mg/100-500μg (很多) |
RNA純度 | 高 | 高 | 高 | 高 |
有毒有害試劑 | 無 | 無 | 無 | 有 |
人體與環境安全 | 高 | 高 | 高 | 低 |
國外同類產品 | RNeasy Mini Kit (Qiagen) PureLink® RNA Mini Kit (Thermo) | PureLink® miRNA Isolation Kit (Thermo) | miRNeasy Mini Kit (Qiagen) | TRIzol (Thermo) |
用途 | 非小RNA相關各種用途 | 小RNA相關各種用途 | 不同長度RNA各種用途 | 不同長度RNA各種用途 |
動物組織或細胞中的RNA按照長度可以分為長鏈RNA(long RNA)和小RNA(small RNA),長鏈RNA通常大于200nt,而小RNA通常小于200nt。長鏈RNA按照是否編碼蛋白或多肽可以分為長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, lncRNA)和mRNA。小RNA主要包括非編碼的5.8S rRNA(ribosomal RNA)、5S rRNA、tRNA(transfer RNA)、microRNA(miRNA)、siRNA(small interfering RNA)、piRNA(Piwi-associated small RNA)、tsRNA(tRNA-derived small RNA)、srRNA(small rDNA-derived RNA)等。
本試劑盒抽提RNA的基本流程如圖1所示。樣品在裂解液中迅速裂解,釋放出總RNA,然后讓RNA特異性地結合到純化柱上,而基因組DNA和蛋白質等其它組分通過高速離心被有效去除,再通過3次洗滌充分去除非特異性結合的蛋白、鹽等雜質,最后用洗脫液將高純度的RNA洗脫下來。
圖1. 離心柱式RNA抽提流程示意圖
本試劑盒使用安全。本試劑盒通過特殊的柱純化介質進行RNA分離純化,能有效避免傳統的Trizol法抽提時使用的酚、氯仿等有毒有害有機試劑。
本試劑盒使用快速、便捷。本試劑盒采用柱純化,無需繁瑣的RNA沉淀步驟,抽提操作過程僅15-20分鐘。相比于傳統的Trizol抽提法,本試劑盒的操作流程顯著簡化,縮短了抽提時間,降低了RNA被降解的風險。和國外同類柱純化產品相比,所需操作步驟和操作時間基本一致。
本試劑盒抽提RNA的得率高,優于國外同類產品。本試劑盒的抽提效果經反復測試,100萬個HeLa細胞能抽提得到約15-20μgRNA,20mg小鼠肝組織能抽提得到約25-35μgRNA,20mg小鼠腦組織中抽提得到約10-20μgRNA(新鮮樣品的得率高于凍存樣品)。本試劑盒與傳統的Trizol方法及國際知名Q品牌同類產品的抽提效果對比參見圖2。
本試劑盒抽提得到的RNA純度高,顯著優于Trizol和國外Q品牌的同類產品。本試劑盒抽提得到的RNA的A260/A280通常為2.0-2.2。A260/A230通常為1.9-2.1。本試劑盒與傳統的Trizol方法及國際知名Q品牌同類產品的抽提效果對比參見圖2。由圖2可知,本試劑盒在抽提組織樣品的RNA時,A260/A230非常顯著地高于Trizol法和Q品牌的同類產品,提示純度高。
圖2. 本試劑盒與Trizol、Q品牌同類產品的RNA抽提效果對比。樣品為凍存的50萬個HeLa細胞、20mg小鼠肝組織和20mg小鼠腦組織。洗脫液用量均為40μl。均取6μl洗脫的樣品經變性處理后,在含6.67%甲醛和適量NA-Red的1.2%變性瓊脂糖凝膠中電泳約45分鐘后拍照。實際抽提效果會因實驗條件、檢測儀器等的不同而存在差異,本圖僅供參考。
注:純的RNA其A260/A280約為2.0,但在很多儀器上測定時會高于2.0,低于1.9通常認為有蛋白、DNA或者酚等的污染;純的RNA其A260/A230約為2.0左右或者略高,低于1.9通常認為有碳水化合物、胍鹽、多肽或酚等的污染。
本產品與Qiagen公司的RNeasy Mini Kit一致,用于純化200nt以上的RNA,對小于200nt的small RNA即小RNA(如5.8S rRNA、5S rRNA、tRNA、miRNA、piRNA等)被選擇性地去除,如果希望抽提得到小于200nt的小RNA,推薦RNAeasy™動物小RNA抽提試劑盒(離心柱式)(R0028)或RNAeasy™ Plus動物RNA抽提試劑盒(離心柱式)(R0032)。
本試劑盒適用于新鮮或凍存的動物組織或細胞RNA的抽提,推薦的細胞用量為50-100萬(上限可達1000萬),組織用量為15-20mg(上限可達30mg)。對于不同的組織或細胞上限會有所差別,例如小鼠肝臟組織的上限可達30mg,但肌肉組織的上限為20mg。
本試劑盒可用于12個樣品的RNA抽提。
包裝清單:
產品編號 | 產品名稱 | 包裝 |
R0024-1 | 裂解液 | 8ml |
R0024-2 | 結合液 | 8ml |
R0024-3 | 洗滌液I | 8ml |
R0024-4 | 洗滌液II | 15ml |
R0024-5 | 洗脫液 | 1.2ml |
R0024-6 | RNA純化柱及廢液收集管 | 12套 |
R0024-7 | RNA洗脫管 | 12個 |
— | 說明書 | 1份 |
保存條件:
室溫保存,一年有效。
注意事項:
對于富含RNase的樣品(如動物組織),建議使用前在裂解液中添加二硫蘇糖醇(Dithiothreitol, DTT)至終濃度為40mM (例如1ml裂解液中加入20μl 2M DTT)或β-巰基乙醇至終濃度為1% (如1ml裂解液中加入10μl β-巰基乙醇)。含DTT或β-巰基乙醇的裂解液可在室溫放置1個月。
通過本試劑盒抽提到的RNA已經去除絕大多數DNA,通常情況無需DNase處理。后續如進行某些對極少量DNA殘留較敏感的實驗時,可以在使用說明中步驟4離心后,在純化柱中加入適量DNase I (如80μl含10U DNase I的酶溶液,推薦使用DNase I,D7076),室溫消化15分鐘。消化結束后,不要離心,直接加入500μl洗滌液II,進入使用說明的步驟5進行操作。
本試劑盒提供的所有試劑和耗材都是RNase-free,操作時應小心,避免被污染。所有自行準備的試劑和耗材也都應是RNase-free。如果可能有RNase污染,可考慮用0.01%的DEPC水浸泡過夜,然后高溫高壓滅菌并烘干。操作時應避免對著樣品或所使用的試劑盒耗材呼氣或說話,以防RNase污染。建議戴一次性口罩操作。
對于操作環境中RNA酶的去除,推薦使用生產的RNase and DNase Away (R0123)以去除實驗桌面上或其它接觸面上的RNase。
使用凍存的細胞或組織抽提RNA的效果通常比新鮮的細胞或組織差一些。因為在細胞或組織凍融過程中一些細胞或組織內的RNase會被釋放出來并剪切樣品中的RNA。對于組織樣品,推薦使用RNALater™動物組織RNA穩定保存液(R0118)進行保存以保證樣品RNA的完整性。
本試劑盒所有操作均在室溫進行,操作時無需冰浴。所有離心也均在室溫進行。
廢液收集管在一次抽提中需多次使用,切勿中途丟棄。
結合液、洗滌液中含有乙醇,使用后須旋緊瓶蓋以防揮發,并須按照易燃試劑的相關規范進行存放和使用。
本產品僅限于專業人員的科學研究用,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅內。
為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。
使用說明:
1. 樣品的準備。
細胞樣品:收集50-100萬左右的細胞。對于懸浮細胞,1000-2000g離心1分鐘后棄上清,加入300μl裂解液,輕輕吹打8-10次至固懸物溶解、溶液澄清;對于貼壁細胞,吸凈培養液后加入300μl裂解液,輕輕吹打5-10次至固懸物溶解、溶液澄清,轉移至一潔凈離心管內。
組織樣品:取15-20mg動物組織,置于液氮中研磨成粉末,立即加入600μl裂解液。也可將組織置于1.5ml離心管中,迅速加入600μl冰浴預冷的裂解液,用微型電動勻漿器勻漿,或者用普通玻璃勻漿器進行勻漿。研磨或勻漿后,輕輕吹打勻漿液8-10次,室溫放置3-5分鐘。然后約14,000g離心2分鐘,將上清液移至新的離心管中。對于比較容易裂解且勻漿很充分的組織(如肝組織、腦組織等)可以不用高速離心而直接進入步驟2。
注意:細胞的數量一般不超過500萬,不超過100萬細胞宜使用300μl裂解液,多于100萬細胞宜使用600μl裂解液。動物組織的用量一般不超過30mg,用量過多可能會因裂解不充分導致得率下降。組織樣品在裂解和離心后,離心管下部可能會有一些膠狀物質,宜作為上清轉移至下一步操作。如果棄除膠狀物,會導致得率下降約30-50%。后續加入結合液后膠狀物會消失。離心是為了去除未勻漿充分的明顯塊狀物。如果裂解后仍有粘稠物,需增加吹打次數至溶液完全澄清。對于富含RNase的樣品,裂解液中宜添加DTT至終濃度為40mM或添加β-巰基乙醇至終濃度為1%。
2. 加入等體積結合液至裂解液中,輕輕顛倒混勻3-5次。此時可能會有沉淀物產生,屬于正常現象。
3. 將混合物(包括沉淀物)轉移至純化柱內,12,000g離心30秒,倒棄收集管內液體。
注意:當裂解液的體積大于300μl時,在加入等體積結合液后,總體積會超過純化柱的容量,這時應分成2次過柱,即將一半的混合物過柱后,再將剩余的混合物重復步驟3一次。對于一些特殊的樣品,如出現溶液未完全通過時,可延長離心時間至1-2分鐘,或者加大離心力至16,000g。對于一些能快速啟動達到12,000g的離心機,離心30秒已經足夠,對于一些啟動速度緩慢的離心機本步驟及后續步驟中的30秒離心宜調整為60秒。
4. 加入600μl洗滌液I,12,000g離心30秒,倒棄收集管內液體。
5. 加入600μl洗滌液II,12,000g離心30秒,倒棄收集管內液體。
6. 重復步驟5一次。
7. 最高速(約14,000-16,000g)離心2分鐘,去除殘留的液體。
8. 將RNA純化柱置于本試劑盒提供的RNA洗脫管中,加入30-50μl洗脫液,室溫放置2-3分鐘,最高速離心30秒,所得溶液即為純化的RNA。
注意:洗脫液需要加到純化柱柱面中央,使其被完全吸收。如需獲得更高濃度的樣品,可把洗脫液的體積減小至20μl,但洗脫下來的RNA量會相對減少。室溫較低時,洗脫液在37℃預熱片刻對得率有所幫助。此外,洗脫后的溶液再次加回到原純化柱再離心洗脫一次,可提高得率約10-30%;或者在第一次洗脫后使用新的洗脫液再洗脫一次,會獲得約為第一次洗脫量15-40%的RNA。