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熒光及可視化 RT-LAMP 擴增試劑盒

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 熒光及可視化 RT-LAMP 擴增試劑盒是根據(jù)本公司的雙染料 RT-LAMP 專利技術(shù)開發(fā)的熒光和可見光雙模式檢測試劑盒,它既可以用于熒光 RT-LAMP 擴增及檢測,也可以用于可視化 RT-LAMP擴增及檢測,適用于各種針對核酸的快速定性檢測。本產(chǎn)品具有下列特點:

1. 含可見光和熒光染料,既可以用金屬浴和水浴擴增用可見光肉眼判斷結(jié)果,也可用熒光 PCR 儀進行實時熒光檢測。

2. 內(nèi)含的 dUTP-UNG 可防交叉污染。

3. 特異性比 RT-PCR 高,因為 RT-LAMP 擴增使用 4-6 條引物而不是兩條。

4. 靈敏性可達 10 拷貝/反應(yīng)以下(隨引物而不同,故假陰性率更低。

只可用于科研,只可進行定性檢測,不能用于定量檢測。

 

編號

塑料盒包裝

MMLV 逆轉(zhuǎn)錄酶(含 RI200U/μL

60905a

50 μL黃蓋

4×RT Buffer(dNTP)

60905b

250 μL白蓋)

5×熒光及可視化LAMP MagicMix

200603a

200 μL綠蓋

Bst DNA 聚合酶 2.0(8U/uL)

200403

50 uL (紅蓋)

RT-LAMP 陽性對照模板-引物混合物

130923a

20 μL(黃蓋

超純水

100935

1mL(亮黃蓋)

使用手冊

200603sc

1 份

 

低溫運輸,-20℃保存,保存期限為一年

 

RT-LAMP 模板及 RT-LAMP 引物、PCR 級石蠟油僅對使用金屬浴或水浴者)。

準備工作:如果使用水浴鍋或金屬浴,需要在實驗啟動前打開并調(diào)到 60-65℃。如果用金屬浴,還必須在孔中加水以填充金屬孔和反應(yīng)管間的空隙。金屬浴和水浴溫控遠遠不如PCR 儀器,所以使用前需要用陽性對照和陰性對照(水)做預(yù)實驗確認可用。一、樣品 RNA 的制備

1. 用自選方法純化樣品的 RNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù) RNA 提取試劑盒兼容。

2. 如果有 N 個樣品,則至少需要做 N+2 個樣品制備,包括一個制備陽性對照制備時加入自備的跟要檢測的靶分子相同的陽性對照模板,一起經(jīng)歷提取過程和一個制備陰性對照(用水替代樣品)。最后 N+2 個樣品一起進行 RNA 提取操作,得 N+2  RNA 樣品。

二、合成 1st-strand cDNA

 

按下表配制 RT 反應(yīng)體系:

 

成分

加入量

 

自備 RNA 模板RNA

 poly(A) mRNA

或?qū)R坏?RNA

注意:RNA 樣品不能有基因組 DNA 污染。

 

100-500 ng

10-500 ng

0.01pg-500ng

自備引物 F3

1 μL

4×RT Buffer(dNTP)

5 μL

自備 RNase-free 

補水到 19 μL

 

4. 70℃保溫 5 分鐘后立即冰浴。

5. 37℃保溫 5 分鐘。對富含二級結(jié)構(gòu)的高 GC RNA 模板,可改成 45℃保溫 5 分鐘。

6. 加入 1μL (=200 U) MMLV 逆轉(zhuǎn)錄酶( RI,終體積為 20μL

7. 42℃保溫 60 分鐘。

8. 70℃保溫 10 分鐘以終止反應(yīng),放置在冰上待用。合成的 cDNA 可以直接作為

LAMP 模板使用,不需要純化。

三、 熒光及可視化 LAMP 擴增及檢測(20μL 體系)

9. 反應(yīng)設(shè)置:如果有 N+2  cDNA 樣品,則最好設(shè)置 N+4 LAMP 擴增,增加 LAMP

陰性對照和 LAMP 陽性對照各 1 個。在 N+4  0.2mL PCR 管中加入下列成分:

10. 混勻后進行擴增。由于本產(chǎn)品含雙染料,可以根據(jù)實驗室條件選擇下列三種方式進行擴增和檢測。

11. 如果使用PCR 儀、金屬浴或水浴進行擴增,肉眼檢測,則必須先在每個反應(yīng)管中 30 μL 自備的石蠟油,否則保溫期間反應(yīng)體系的水分會蒸發(fā),影響反應(yīng)效率(如果使用 PCR 儀器并開啟熱蓋,則可以不加石蠟油60-65℃保溫 90 分鐘,肉眼觀察管內(nèi)液體顏色。

 

12。如果使用熒光定量 PCR 儀:設(shè)為 60-65℃保溫 1 分鐘/循環(huán), 90 個循環(huán),每分

鐘在 FAM 通道采集一次熒光信號。

 

13. 如果使用PCR 儀、金屬浴或水浴進行擴增,再使用 qPCR 儀進行終點法熒光讀數(shù): 則在擴增前和擴增后,分別在 qPCR 儀器上測熒光讀數(shù)溫度設(shè)為 60-65℃,1 次循環(huán),每次循環(huán) 1 分鐘,在 FAM 通道采集一次熒光信號。注意:測熒光讀數(shù)必須在 65℃進行。擴增反應(yīng)按 60-65℃,90 分鐘進行。

四、 結(jié)果分析及解讀

14. 如果是用普通PCR 儀器、水浴或金屬浴進行的擴增,反應(yīng)結(jié)束后只能肉眼判斷結(jié)果。將反應(yīng)管放置在白色背景如白紙前觀察。擴增陽性對照管內(nèi)反應(yīng)液將呈現(xiàn)藍色,無模板和無引物的陰性對照將呈淺藍色。如果擴增陽性對照管內(nèi)反應(yīng)液不呈現(xiàn)藍色,或無模板和無引物的陰性對照任何一個呈現(xiàn)藍色,則說明試劑有問題,實驗無效。請跟廠家聯(lián)系。

15. 如果實驗有效,則分析 N+2 個樣品管的結(jié)果。如果樣品管反應(yīng)液的顏色接近擴增陽性對照管則說明有擴增,如果接近無模板和無引物的陰性對照,則說明無擴增。反應(yīng)結(jié)果示例見左圖9 為陰性10 為陽性)。

16. 如果是用熒光PCR 儀進行擴增,則可分析擴增曲線和 Ct。試劑盒提供的陽性對照 Ct 將小于 60,如果大于 60,說明試劑可能失效,需跟廠家聯(lián)系。無模板陰性對照和無引物陰性對照的 Ct 將大于 90。如果任何小于 90,則說明試劑或環(huán)境被污染,需重復(fù)實驗或跟廠家聯(lián)系。如果陽性對照和陰性對照 Ct 都在正常范圍,則分析樣品的 CtCt 小于 60 的判斷為陽性,大于 90 判為陰性,在 60-90 之間則需要重復(fù)檢測。

17. 如果使用 PCR 儀、金屬浴或水浴進行擴增,肉眼檢測,再使用熒光定量 PCR 進行終點法熒光讀數(shù)來判斷陰陽性,則先比較陽性對照和陰性對照。陽性對照樣品擴增后信號增幅應(yīng)該超過 100%,陰性對照擴增后信號增幅應(yīng)該低于 50%,否則實驗無效,請與廠家聯(lián)系。如果兩個對照均有效,則比較樣品擴增前后熒光讀數(shù)的差值。如果擴增后熒光信號增幅低于 50%,則判斷為陰性。如果熒光信號增幅高 100%,則判斷為陽性。熒光信號增幅在 50-100%之間的,則需要重測。

18. 當實時熒光檢測和可視化檢測同時用于判讀結(jié)果時,如果彼此不一致,以實時熒光LAMP 的數(shù)據(jù)為準。一般可視化結(jié)果滯后實時熒光檢測結(jié)果 20-30 分鐘,也就是說,在 qPCR 儀上第 30 分鐘時呈現(xiàn)陽性的樣品,其反應(yīng)液的顏色變化一般在第

 

50-60 分鐘時才能觀察到。

 

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