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煙曲霉探針法熒光定量PCR試劑盒

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煙曲霉(Aspergillus fumigatus.)屬殼霉目、杯霉科、煙曲霉屬,是一種重 要的致病菌,也是引起食品腐敗的一種真菌。煙曲霉的菌落生長迅速,絨狀或作 一定的絮狀,暗煙綠色,老后色變得更深。此菌嗜高溫,在 45℃或更高的溫度下 生長茂盛。在糧食發熱霉變的中期和后期常大量出現,促進糧溫的升高和敗壞。 煙曲霉能寄生在人、鳥類及其它脊椎動物的肺部引起結核癥。也能侵染棉鈴和蘋 果等,引起果實腐爛,或寄藏于種子上。因此快速檢測煙曲霉具有重要意義。本 產品就是以探針法熒光定量 PCR 技術為基礎開發的專門檢測煙曲霉的試劑盒,它 具有下列特點:

1.即開即用,用戶只需要提供樣品DNA模板。

2.引物和探針經過優化,靈敏性高。

3.提供陽性對照,便于區分假陰性樣品。

4.特異性高,引物是根據煙曲霉的高度保守區設計,不會跟其他微生物DNA發生交叉反應。

5.本產品足夠50次20μL體系的探針法熒光定量PCR反應。

本產品只能用于科研。

 

編號

五孔包裝

2×Probe qPCR MagicMix

190303

500μL(本色蓋)

熒光PCR專用模板稀釋液

180701

1mL(紅蓋)

超純水

100935

1mL(紫蓋)

煙曲霉探針法qPCR

引物-探針混合液

yp15-26720

150μL(棕色管)

煙曲霉PCR陽性對照

 (1×10E7拷貝/μL)

pc26720

50μL(黃

一、稀釋標準曲線樣品(以10E1-10E6拷貝/μL這6個10倍稀釋度為例)。由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產品穩定性和避免擴散傳染性病原,本產品不提供活體樣品做陽性對照,只提供無傳染性DNA片段作為陽性對照。

1. 標記6個離心管,分別為6,5,4,3,2,1。

2. 用帶芯槍頭分別加入45μL熒光PCR專用模板稀釋液,最好用帶芯槍頭,下同)

3. 6號管中加入5μL 10E7拷貝/μL的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得10E6拷貝/μL的標準曲線樣品。放冰上待用。

4. 換槍頭,在5號管中加入5μL 10E6拷貝/μL的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得10E5拷貝/μL的標準曲線樣品。放冰上待用。

5. 換槍頭,在4號管中加入5μL 1×10E5拷貝/μL的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得10E4拷貝/μL的標準曲線樣品。放冰上待用。

6. 重復上面的操作直到得到6個稀釋度的標準曲線樣品。放冰上待用。

二、樣品DNA的制備

7. 如果N個樣品,最好設置N+2個提取,多出的一個是PC(樣品制備陽性對照)一個是NC樣品制備陰性對照)。可以用10μL 4號稀釋液(第6步所得)再加上一定量的水使總體積跟次制備要求的體積一樣以此作為樣本制備PC另外用水作為樣本制備NC。

8. 用自選方法純化樣品的DNA,本擴增試劑盒跟市場上大多數細菌DNA提取試劑盒兼容。也可以使用本公司的免提取的核酸釋放劑。

三、Probe qPCR反應(20μL體系,在樣品制備室進行

 

9. 如果做定量分析并且只做1次重復,則標記N+9個PCR管,其中N+2個于上步得到N+2個樣品1個用于PCR陰性對照(用水做模板),6個用標準曲線。如果做定性分析并且只做1次重復,則標記N+4個PCR管,其中N+2個于上步得到N+2個樣品1個用于PCR陰性對照(用水做模板),1個用于PCR性對照(可直接用第6步所得的第4號稀釋液)下面只以定量分析為例描述操作步驟

 

10. 標記管中下表加入各成分(本表只列出一次重復。樣品管和陰性對照設置完畢后才設置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋子儲存后最后加):

 

成分

樣品管

N+2

PCR陰性對照管

標準曲線樣品管

1-6管)

2×Probe qPCR MagicMix

10μL

10μL

10μL

煙曲霉探針法qPCR引物-探針混合液

3μL

3μL

3μL

 N+2個待測DNA模板

7μL

不加

不加

超純水

不加

7μL

不加

6所得標準曲線樣品稀釋液1-6

不加

不加

7μL(1號樣1號管2號樣2號管

11. 蓋上蓋子后上機,按下面參數進行PCR:

 

過程

溫度

時間

預變性

95

10 min

PCR反應

45個循環)

95

15sec

55℃

72℃


20sec

30sec(采集FAM通道的熒光信號

數據處理

1. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的Ct值從標準曲線上推算出樣品DNA濃度的log值,推算出其濃度

 

如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照Ct必須大于或等于40。陽性對照必須有熒光對數增長,有典型擴增曲線,Ct值應該小于或等于38。對待測樣品,如果其Ct大于或等于40則為陰性,如果小于或等于38則為陽性。如果在38-40之間,則重復一次。重復實驗的Ct值如果大于或等于40則為陰性,如果小于40,則為陽性。

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