pCMV-AT1.03 (ATP熒光探針)是自行研發(fā)的含有CMV啟動(dòng)子用于在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中表達(dá)AT1.03蛋白以作為ATP熒光探針的工具質(zhì)粒。本質(zhì)粒表達(dá)的ATP熒光探針被稱為ATeam,即基于FoF1-ATP合成酶ε亞基的ATP指示劑(Adenosine 5'-Triphosphate indicator based on Epsilon subunit for Analytical Measurements)。AT1.03是一種低親和力的ATeam (Kd=3.3mM at 37℃),可以檢測(cè)毫摩爾級(jí)的ATP水平。pCMV-AT1.03質(zhì)粒在轉(zhuǎn)染哺乳動(dòng)物細(xì)胞后,AT1.03蛋白主要分布在細(xì)胞質(zhì)中,適合用于實(shí)時(shí)監(jiān)控細(xì)胞質(zhì)內(nèi)的ATP濃度變化。
AT1.03蛋白是以熒光共振能量轉(zhuǎn)移(fluorescence resonance energy transfer, FRET)為基礎(chǔ)的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)單個(gè)活細(xì)胞內(nèi)的ATP水平及其實(shí)時(shí)變化的ATP熒光探針。該熒光探針由N端的青色熒光蛋白(cyan fluorescent protein) mseCFPΔC11 (激發(fā)光波長(zhǎng)435nm,發(fā)射光波長(zhǎng)475nm)、枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)的FoF1-ATP合成酶的ε亞基以及C端的黃色熒光蛋白(yellow fluorescent protein) cp173-mVenus (激發(fā)光波長(zhǎng)515nm,發(fā)射光波長(zhǎng)527nm)融合而成(參考圖1)。枯草芽孢桿菌的FoF1-ATP合成酶的ε亞基是幾乎最小的ATP結(jié)合蛋白(14kDa),它由一個(gè)N端β桶狀結(jié)構(gòu)域和兩個(gè)C端α螺旋結(jié)構(gòu)域組成。作為基于FRET的ATP熒光探針,F(xiàn)oF1-ATP合成酶的ε亞基具有幾個(gè)突出優(yōu)點(diǎn):ε亞基與ATP結(jié)合,但不水解ATP;結(jié)合ATP,但不結(jié)合ADP、GTP、CTP以及UTP;當(dāng)ATP結(jié)合時(shí),ε亞基發(fā)生很大的構(gòu)象變化形成一個(gè)折疊的構(gòu)象(folded form),從而使N端的青色熒光蛋白以及C端的黃色熒光蛋白得以在空間上接近,而發(fā)生熒光共振能量轉(zhuǎn)移(激發(fā)光波長(zhǎng)435nm,發(fā)射光波長(zhǎng)527nm)。
圖1.AT1.03蛋白結(jié)構(gòu)圖。
pCMV-AT1.03質(zhì)粒轉(zhuǎn)染Hela細(xì)胞后的ATP熒光探針表達(dá)效果請(qǐng)參考圖2。
圖2.pCMV-AT1.03質(zhì)粒轉(zhuǎn)染Hela細(xì)胞后的ATP熒光探針表達(dá)效果圖。A圖為明場(chǎng)照片,B圖為熒光照片。
AT1.03的熒光信號(hào)在pH7.1-8.5之間非常穩(wěn)定,這樣AT1.03的熒光信號(hào)在正常細(xì)胞質(zhì)內(nèi)(pH7.3左右)幾乎不會(huì)發(fā)生波動(dòng)。ATP的結(jié)合常數(shù)Kon為1.7×10-2mM-1s-1,ATP的解離常數(shù)Koff為9.8×10-2s-1,因此AT1.03可用于監(jiān)控細(xì)胞內(nèi)高達(dá)0.1s-1 ATP的動(dòng)態(tài)變化,特別適合用于實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)超短時(shí)間內(nèi)的ATP濃度變化。
pCMV-AT1.03 (ATP熒光探針)為卡那霉素抗性,轉(zhuǎn)染細(xì)胞后,可使用G418篩選穩(wěn)定表達(dá)目的蛋白的細(xì)胞株。
pCMV-AT1.03質(zhì)粒的主要信息如下:
Feature Nucleotide | Position |
CMV promoter | 1–602 |
T3 promoter and T3 primer binding site | 620–639 |
AT1.03 | 699-2534 |
multiple cloning site | 651-692/2535-2558 |
T7 promoter and T7 primer binding site | 2581–2629 |
SV40 polyA signal | 2641–3024 |
f1 origin of ss-DNA replication | 3162–3466 |
bla promoter | 3491–3615 |
SV40 promoter | 3635–3973 |
neomycin/kanamycin resistance ORF | 4008–4799 |
HSV-thymidine kinase (TK) polyA signal | 4800–5258 |
pUC origin | 5387–6054 |
pCMV-AT1.03質(zhì)粒(6106bp)的圖譜如下:
pCMV-AT1.03中沒有的酶切位點(diǎn)(Restriction enzymes that do not cut pCMV-AT1.03)包括:
AclI | AfeI | AflII | AgeI | AhdI | AscI | AsiSI |
BaeI | BbsI | BbvCI | BlpI | BsiWI | BsmBI | BspEI |
BspQI | BssHII | BstEII | BstZ17I | EarI | EcoNI | Esp3I |
FseI | HindIII | NruI | PflMI | PmeI | PmlI | PpuMI |
PshAI | PspXI | SalI | SapI | SbfI | ScaI | SgrAI |
SwaI | XcmI | XmnI |
pCMV-AT1.03中的單酶切位點(diǎn)(Restriction enzymes that cut pCMV-AT1.03)包括:
AccI | GT`MK,AC | 1432 | NarI | GG`CG,CC | 4136 |
ApaLI | G`TGCA,C | 5740 | NdeI | CA`TA,TG | 240 |
BamHI | G`GATC,C | 687 | NheI | G`CTAG,C | 597 |
BclI | T`GATC,A | 2795 | NotI | GC`GGCC,GC | 672 |
BglII | A`GATC,T | 2535 | PaeR7I | C`TCGA,G | 2541 |
BmgBI | CAC|GTC | 1772 | PciI | A`CATG,T | 6054 |
BmtI | G,CTAG`C | 597 | PflFI | GACN`N,NGTC | 4254 |
BsaI | GGTCTCN`NNNN, | 5125 | PluTI | G,GCGC`C | 4135 |
BsaXI | ,NNN`(N)9AC(N)5CTCC(N)7,NNN` | 3185 | PvuI | CG,AT`CG | 2639 |
BsrDI | GCAATG,NN` | 4367 | RsrII | CG`GWC,CG | 4652 |
BsrGI | T`GTAC,A | 1990 | SacI | G,AGCT`C | 651 |
BstBI | TT`CG,AA | 4818 | SacII | CC,GC`GG | 660 |
BstXI | CCAN,NNNN`NTGG | 663 | SfiI | GGCCN,NNN`NGGCC | 3908 |
CspCI | ,NN`(N)11CAA(N)5GTGG(N)10,NN` | 380 | SfoI | GGC|GCC | 4137 |
DraIII | CAC,NNN`GTG | 3251 | SmaI | CCC|GGG | 682 |
Eco53kI | GAG|CTC | 653 | SnaBI | TAC|GTA | 346 |
EcoRI | G`AATT,C | 1791 | SpeI | A`CTAG,T | 2553 |
EcoRV | GAT|ATC | 1445 | SrfI | GCCC|GGGC | 682 |
HincII | GTY|RAC | 2901 | StuI | AGG|CCT | 3957 |
HpaI | GTT|AAC | 2901 | TspMI | C`CCGG,G | 680 |
KasI | G`GCGC,C | 4135 | Tth111I | GACN`N,NGTC | 4254 |
MfeI | C`AATT,G | 2888 | XbaI | T`CTAG,A | 2547 |
MluI | A`CGCG,T | 3024 | XhoI | C`TCGA,G | 2541 |
MscI | TGG|CCA | 4218 | XmaI | C`CCGG,G | 680 |
如需對(duì)pCMV-AT1.03質(zhì)粒中插入片段AT1.03進(jìn)行測(cè)序時(shí),推薦使用的正向測(cè)序引物T3和反向測(cè)序引物T7的序列如下:
T3 primer (620-639): 5' AATTAACCCTCACTAAAGGG 3'
T7 primer (2581–2629): 5' GTAATACGACTCACTATAGGGC 3'
包裝清單:
產(chǎn)品規(guī)格 | 產(chǎn)品名稱 | 包裝 |
1μg | pCMV-AT1.03 (ATP熒光探針) | 1μg |
100μg | pCMV-AT1.03 (ATP熒光探針) | 100μg |
- | 說明書 | 1份 |
保存條件:
-20℃保存。
注意事項(xiàng):
本質(zhì)粒未經(jīng)書面許可不得用于任何商業(yè)用途,也不得移交給訂貨人所在實(shí)驗(yàn)室外的任何個(gè)人或單位。
本產(chǎn)品僅限于專業(yè)人員的科學(xué)研究用,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅內(nèi)。
為了您的安全和健康,請(qǐng)穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。
使用說明:
1.首次使用1µg包裝的本產(chǎn)品時(shí),請(qǐng)先取少量本質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌,進(jìn)行質(zhì)粒小量、中量或大量抽提后再用于后續(xù)用途。抽提獲得的質(zhì)粒可以通過酶切電泳進(jìn)行鑒定,或通過測(cè)序進(jìn)行鑒定。
2.100µg包裝的本產(chǎn)品質(zhì)粒濃度為0.1µg/µl,共1ml。可以直接用于酶切或者轉(zhuǎn)染細(xì)胞。