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Benzonase核酸酶

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Benzonase核酸酶,是一種核酸內(nèi)切酶,可將核酸降解成2~5個(gè)堿基的5‘單磷酸核苷酸,因其能高效降解任何形式(雙鏈,單鏈,線狀,環(huán)狀)的DNA和RNA而沒(méi)有蛋白裂解活性,又被稱為“全能核酸酶”。Benzonase核酸酶能有效降低蛋白樣品粘度,去除蛋白樣品中核酸的污染,且無(wú)蛋白酶活性殘留,核酸酶活性達(dá)1×106 U/mg蛋白。Benzonase核酸酶在降低粘性的同時(shí), 也具有多種其他用途,如:減少了樣品處理時(shí)間,增加了蛋白產(chǎn)量,離心時(shí)時(shí)沉淀和上清分離的更徹底,更便于溶液的離心(尤其是超濾);提高色譜純化的效率等。
本公司Benzonase核酸酶包括四種,分別為不含任何標(biāo)簽的Benzonase核酸酶(科研級(jí)別)、無(wú)內(nèi)毒素Benzonase核酸酶Strep tagII Benzonase核酸酶(科研級(jí)別)和無(wú)內(nèi)毒素的Strep tagII Benzonase核酸酶,可適應(yīng)不同下游用途的需求。其中Strep tagII Benzonase核酸酶可在消化完核酸后通過(guò)Strep Tactin XT Resin高效去除,而無(wú)內(nèi)毒素的兩種Benzonase核酸酶,內(nèi)毒素含量<40EU/mL(按照單位換算量計(jì)算為,每1000U中含有的內(nèi)毒素<0.15EU),可適用于藥用級(jí)別的研發(fā)和生產(chǎn)。另外,核酸酶殘留可通過(guò)我公司開發(fā)的基于 熒光探針的Benzonase核酸酶殘留檢測(cè)試劑盒進(jìn)行評(píng)測(cè),15min即可完成檢測(cè),最低可檢測(cè)到2ng/ml的核酸酶殘留。

 

用量推薦

實(shí)驗(yàn)類型 電泳蛋白樣品制備 非藥物蛋白生產(chǎn) 藥物蛋白生產(chǎn) 疫苗、病毒生產(chǎn) 細(xì)胞藥物
推薦產(chǎn)品 Benzonase(科研級(jí)) Benzonase(科研級(jí))
Strep-tagII Benzonase(科研級(jí))
Benzonase(無(wú)內(nèi)毒素級(jí))
Strep-tagII Benzonase(無(wú)內(nèi)毒素級(jí))
細(xì)胞數(shù)量 1X106個(gè)細(xì)胞(10mg組織) 1g濕重 (重懸液10mL) 1L 發(fā)酵上清液 1L 培養(yǎng)物
最低用量 125U (0.5 µL) 25U/mL(1 µL) 25U/mL(1 µL) 0.1U/mL(0.4 µL) 0.1U/mL(0.4 µL)
推薦用量 500U (2 µL) 250U/mL(10 µL) 250U/mL(10 µL) 25U/mL(100 µL) 5U/mL(20 µL)
作用時(shí)間 通常作用時(shí)間37℃在15~60min;25℃在30~120min;

單位定義

37℃,pH 8.0反應(yīng)條件下,在30分鐘內(nèi)使△A260 值降低1.0(相當(dāng)于完全消化37 μg DNA )的酶量定義為一個(gè)活性單位。
注意:含大量蛋白、細(xì)胞壁、其它鹽分的粗制品,對(duì)該酶活性有部分抑制作用,使用時(shí)需要增加酶的用量。

應(yīng)用

  • 蛋白提取時(shí)去除核酸污染:在重組蛋白純化或組織細(xì)胞樣品蛋白提取時(shí),Benzonase核酸酶可有效降低樣品粘度,利于下游操作
  • 與細(xì)胞或細(xì)菌裂解液配合使用,去除粗提物中的核酸,降低溶液粘性,提高蛋白質(zhì)產(chǎn)量
  • 減少存放的外周血單細(xì)胞(PBMC)的結(jié)塊現(xiàn)象
  • 降解核酸,利于不可溶性蛋白復(fù)性前高質(zhì)量包涵體制備
  • 有效去除帶負(fù)電荷的核酸對(duì)雙向SDS-PAGE蛋白樣品的影響,改善蛋白質(zhì)的分離效果,增強(qiáng)2-DE分辨率
  • 疫苗和病毒樣品制備中DNA污染的去除

儲(chǔ)存

置于-20°C,可保存2年。

實(shí)例分析

benzonase核酸酶消化DNA benzonase核酸酶增加2D電泳的分辨率
Fig1. 分別取不同量(0、0.125、0.25、0.5、1、5、10U)的Benzonase核酸酶消化人基因組DNA10min,進(jìn)行瓊脂糖電泳。 Fig2. A為未加Benzonase處理的,B為加Benzonase處理的
樣品進(jìn)行二維電泳。如圖所示,Benzonase處理的樣品可顯
著增加二維電泳的分辨率。
             Benzonase核酸酶降解基因組DNA Benzonase核酸酶降解基因組DNA
Fig3.經(jīng)RIPA裂解未經(jīng)Benzonase核酸酶處理的樣品,
大量基因組DNA釋放出來(lái),呈鼻涕狀。
Fig4.離心后,左管為未加Bezonase核酸酶,有鼻涕狀
粘稠物質(zhì)懸浮在管中,右管為加Bezonase核酸酶,上
清為透明液體。

超強(qiáng)兼容性

全能核酸酶在非常廣泛的條件下,都能保持很高的穩(wěn)定性和消化核酸的活性,這使其能夠與多種細(xì)胞裂解液,如RIPA,或含有多種離子和非離子型去污劑、還原劑的蛋白提取試劑等兼容。例如:>100mM的鹽酸胍會(huì)完全抑制Benzonase活性,1mM的EDTA會(huì)部分抑制Benzonase活性,5mM的EDTA會(huì)使活性喪失90%,1mM的PMSF則不會(huì)抑制核酸酶活性。 濃度<0.4%的Triton® X-100對(duì)核酸酶活性幾乎無(wú)影響,<0.4%的脫氧膽酸鈉使核酸酶可保持70%的活性,超過(guò)該臨界值之后核酸酶活性會(huì)急劇降低,1%的濃度會(huì)使活性喪失70%;0.05%的SDS對(duì)核酸酶活性幾乎無(wú)影響,而SDS濃度在0.1%-1%之間時(shí),核酸酶在變性后活性會(huì)急劇降低,可通過(guò)增加核酸酶的量使活性得到補(bǔ)償。另外,核酸酶可耐受6M尿素,當(dāng)尿素達(dá)到7M時(shí),核酸酶在變性后活性會(huì)急劇降低,亦可通過(guò)增加核酸酶的量使活性得到補(bǔ)償。
條件參數(shù) 最適條件 可作用條件范圍
Mg2+ 1-2mM 1-10mM
pH 8.0–9.2 6–10
溫度 37°C 0–42°C
DTT 0–100mM >100mM
β-Mercaptoethanol 0–100mM >100mM
一價(jià)陽(yáng)離子濃度(如Na+,K+) 0–20mM 0–150mM
PO43- 0–10 mM 0–100mM

Benzonase的去除

對(duì)于Strep-tag II標(biāo)簽的Benzonase核酸酶(C2003,C2004)可通過(guò)Strep Tactin XT Resin(HaiGene,C0402)直接 去除,去除率>95%;對(duì)于不帶標(biāo)簽的Benzonase核酸酶(C2001,C2002),可通過(guò)色譜純化去除核酸酶,然后可通過(guò)檢測(cè)殘留活性(HaiGene, C2005)或ELISA檢測(cè)來(lái)判斷去除是否成功。常見的色譜純化方式有陽(yáng)離子交換介質(zhì)和陰離子交換介質(zhì),具體的Benzonase去除條件如下表:
陰離子交換介質(zhì) pH 樣品和平衡緩沖液 Benzonase核酸酶
TMAE 7.0 50mM Tris/200mM NaCl not bound
TMAE 7.0 50mM Tris/50mM NaCl not bound
TMAE 8.0 50mM Tris/250mM NaCl not bound
TMAE 8.0 >50mM Tris/100mM NaCl not bound
TMAE 9.0 >50mM Tris/200mM NaCl not bound
TMAE 9.0 50mM Tris/100mM NaCl not bound
DEAE 7.0 50mM Tris/200mM NaCl not bound
DEAE 7.0 50mM Tris/50mM NaCl not bound
DEAE 8.0 50mM Tris/250mM NaCl not bound
DEAE 8.0 >50mM Tris/100mM NaCl not bound
DEAE 9.0 >50mM Tris/250mM NaCl not bound
DEAE 9.0 50mM Tris/50mM NaCl not bound
DMAE 8.0 >50mM Tris/250mM NaCl not bound
DMAE 8.0 50mM Tris/50mM NaCl not bound
陽(yáng)離子交換介質(zhì) pH 樣品和平衡緩沖液 Benzonase核酸酶
SO3- 6.0 20mM phosphate/100mM NaCl bound
SO3- 6.0 20mM phosphate/200mM NaCl not bound
SO3- 5.0 20mM acetate/200mM NaCl bound
SO3- 5.0 >20mM acetate/700mM NaCl not bound
SO3- 4.0 >20mM acetate/300mM NaCl bound
SO3- 4.0 20mM acetate/800mM NaCl not bound
C00- 6.0 20mM phosphate/0mM NaCl not bound
C00- 5.0 20mM acetate/40mM NaCl bound
C00- 5.0 20mM acetate/100mM NaCl not bound
C00- 4.0 >20mM acetate/150mM NaCl partially bound
C00- 4.0 20mM acetate/400mM NaCl not bound
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